Der Öffentliche Dienst der Wallonie ist die zuständige Behörde für die Kontrolle von Natura 2000. Mehrere Abteilungen der Verwaltung sind daran beteiligt. Die Abteilung Natur und Forsten und die Abteilung Polizei und Kontrollen sind befugt, vor Ort die Einhaltung der Natura-2000-Gesetzgebung zu überwachen. Die Abteilung Beihilfen ist für die administrativen Kontrollen in Bezug auf die Anträge auf Natura-2000-Entschädigungen verantwortlich. Bei Feststellung von Zuwiderhandlungen sind Kürzungen der Entschädigungen, Ausschlüsse oder Strafen vorgesehen.
